Celem projektu jest opracowanie metody diagnostyki dwóch najbardziej onkogennych typów wirusa brodawczaka ludzkiego (ang. Human Papillomavirus) HPV typ 16 oraz HPV typ 18 niewymagającej pełnej procedury izolacji materiału genetycznego z wymazu z gardła/śliny wraz wstępną walidację zestawu do diagnostyki HPV 16 oraz HPV 18 w oparciu o identyfikację genetyczną za pomocą metody Real-Time LAMP – Real-Time Loop Mediated Isothermal Amplification.
Dzięki uproszczonej technice procedowania próbki możliwe będzie wykorzystania podejścia znanego jako Direct-LAMP – upraszczającego żmudny proces izolacji materiału genetycznego.
W skład zestawu testowego wchodzić będzie:
- Zestaw buforów do przechowywania próbki i/lub przyspieszonej izolacji materiału genetycznego.
- MasterMix (mieszanina zawierająca wszystkie komponenty reakcji amplifikacji za wyjątkiem analizowanej próbki i ewentualnie wody) do wykrywania dwóch najbardziej onkogennych typów wirusa HPV zawierający wszystkie niezbędne komponenty testu (m.in. polimeraza o właściwościach przemieszczania nici, dNTPs, UDG) oraz ewentualnie kontrola wewnętrzna ukierunkowana na ludzkie DNA.
- Kontrola dodatnia testu – cDNA dla namnażanych na etapie amplifikacji fragmentów genomu HPV 16 oraz HPV 18 oraz ludzkiego materiału genetycznego.
Realizacja Projektu planowana jest na 10 miesięcy i została podzielona na 3 zadania:
● Zadanie 1. Prace nad opracowaniem zestawu buforów do przechowywania próbki i/lub przyspieszonej izolacji materiału genetycznego.
● Zadanie 2. Prace nad skróceniem czasu amplifikacji materiału genetycznego w teście Direct do mniej niż 15 min.
● Zadanie 3. Prace nad analizą kompatybilności zestawu diagnostycznego z wiodącymi termocyklerami Real-Time PCR.
Opisywany Projekt B+R realizowany będzie w ramach fazy PoC.
Działania badawczo-rozwojowe będą prowadzone w Polsce; ich rezultaty będą podlegały ochronie m.in. na terytorium Polski.